電池負極側的氫電極（燃料電極）進入氫氣，正極側的氧化電極（空氣或氧氣）進入空氣或氧氣。正負極之間沒有電解質(zhì)，電解質(zhì)將兩極分開。根據(jù)燃料電池類型，使用不同的電解質(zhì)，包括酸、堿、熔鹽或固體電解質(zhì)。在燃料電池中，燃料和氧化劑與催化劑反應，通過能量轉換過程中的電化學反應產(chǎn)生電能和水（H2O）。因此，不會排放氮氧化物（NOX）、碳氫化合物（HC）和其他污染大氣環(huán)境的氣體。

燃料電池與普通電池的區(qū)別在于：

1.燃料電池是一種能量轉換裝置，其在運行期間必須輸入能量（燃料）以產(chǎn)生電能。普通電池是一種儲能裝置。它必須首先將電能存儲在電池中。它只能在運行期間輸出電能，而不需要在運行期間輸入能量或產(chǎn)生電能。這是燃料電池和普通電池的本質(zhì)區(qū)別。

2.一旦確定了燃料電池的技術性能，其所能產(chǎn)生的電能僅與燃料供應有關。只要供應燃料，就可以產(chǎn)生電能，并且其放電特性是連續(xù)的。普通蓄電池的技術性能確定后，只能在其額定范圍內(nèi)輸出電能，只能在反復充電后重復使用。其放電特性是間歇性的。

3.燃料電池主體的質(zhì)量和體積不大，并且這種燃料存儲裝置或燃料轉換裝置和輔助裝置的質(zhì)量和體積遠大于燃料電池本身。在工作過程中，燃料隨著燃料電池電能的產(chǎn)生而逐漸消耗，質(zhì)量逐漸減少（指船上的有限燃料）。普通電池沒有其他附加設備。在確定技術性能后，電池的質(zhì)量和體積基本保持不變，無論是充滿電還是放電。

4.燃料電池將化學能轉化為電能，普通電池也將化學能轉換為電能這是它們的共同特點。然而，當燃料電池產(chǎn)生電能時，參與反應的反應物在反應后被持續(xù)消耗，不再被重復使用。因此，必須連續(xù)地進入反應物。普通電池的活性物質(zhì)隨著電池的充電和放電而變化。活性物質(zhì)經(jīng)歷反復可逆的化學變化?；钚晕镔|(zhì)不消耗，只需要添加一些電解質(zhì)和其他物質(zhì)。